無菌室的空氣殺菌根據國內一般習慣，制藥廠制劑車間無菌室的殺菌燈是在上班前半小時由值班員打開，上班后工作人員經淋浴更衣進入潔凈室時關殺菌燈，開日光燈;下班后工作人員離開無菌
室時關日光燈，開殺菌燈，半小時后由值班人員斷開殺菌燈總開關。按照這樣的操作程序，在設計時就要求將殺菌燈和日光燈的電路分開，總開關則設在潔凈區的人口處或值班室內，
在潔凈區內每個房間門口設分開關，殺菌燈和日光燈的分開關設在一起時，應以不同顏色的蹺板進行區分。
為了增加紫外線的反射，紫外燈宜盡量靠近頂棚，同時還可以在頂棚上加裝反射率高的拋光鋁反射板，以加強殺菌效果。
一般，制劑車間的無菌室都有吊頂，吊頂離地面的高度為2.7～3m。如果房間為上部送風，燈具的布置必須和風口的布置相協調，這時可采用日光燈和紫外線燈組合裝配的成套
燈具。
對不同大小房間進行空氣消毒時，所需的燈具數也相應不同，如對上部空氣的殺菌率要求達到99%時(殺菌線量需達到23uW–lmin/cm2)
一般無菌室的殺菌率要求達到99.9%(殺菌線量需達到34,5uW·min/cm2)。目前，由殺菌率來精確計算所需的紫外燈數，尚有一定的困難(由于實際計算很復雜，涉及到房間的
換氣次數，頂棚、壁面、地板表面的反射效率，及操作室中的人數等多方面因素)。根據使用單位的經驗，可以每7～l0m2安裝一支30W的殺菌燈。但有一點需要特別注意，潔凈室在經過檢驗達到無菌要求后，房間人數不能再隨意增加，以免影響殺菌效果。
